gene name: araD
| locus tag k12 | ECK0062 | information on phylogenetic profile |
|---|---|---|
| locus tag mg1655 | b0061 | |
| locus tag w3110 | JW0060 | |
| gene name k12 | araD | |
| locus name | araD | |
| synonyms of locus name |
| scop id | 53639 |
|---|---|
| superfamily | Class II aldolase |
| pfam id | PF00596 |
| pfam domain | Class II Aldolase and Adducin N-terminal |
| tigrfam id | TIGR00760 |
| name | araD |
| function | L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase |
| swissprot name | ARAD_ECOLI |
|---|---|
| description | L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase (EC 5.1.3.4) (Phosphoribulose|isomerase). |
| seq length | 231 |
| fastaseq |
| go id | GO:0005737; GO:0016052; GO:0016052 |
|---|---|
| go term | cytoplasm; carbohydrate catabolism; carb catab |
| gene product description | L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase |
|---|---|
| comment gene product description | |
| evidence | E |
| context | |
| gene product desc | Enzyme |
| cell location | Cytoplasmic |
| features | CDS |
| functional category code | G |
|---|---|
| functional category | Carbohydrate transport and metabolism |
| reference #1 | The organization of the araBAD operon of Escherichia coli. Lee N., Gielow W., Martin R., Hamilton E., Fowler A. (Gene. 1986; 47(2-3):231-44) |
|---|---|
| reference #2 | Escherichia coli DNA polymerase II is homologous to alpha-like DNA polymerases. Iwasaki H., Ishino Y., Toh H., Nakata A., Shinagawa H. (Mol Gen Genet. 1991 Apr; 226(1-2):24-33) |
| reference #3 | DNA polymerase II is encoded by the DNA damage-inducible dinA gene of Escherichia coli. Bonner C., Hays S., McEntee K., Goodman M. (Proc Natl Acad Sci U S A. 1990 Oct; 87(19):7663-7) |
| reference #4 | Nucleotide sequence of the araD gene of Escherichia coli K12 encoding the L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase. Mineno J., Fukui H., Ishino Y., Kato I., Shinagawa H. (Nucleic Acids Res. 1990 Nov 25; 18(22):6722) |
| reference #5 | Nucleotide sequence and deletion analysis of the polB gene of Escherichia coli. Chen H., Sun Y., Stark T., Beattie W., Moses R. (DNA Cell Biol. 1990 Nov; 9(9):631-5) |
| phylogenetic profile |
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