gene name: glgX
| locus tag k12 | ECK3417 | information on phylogenetic profile |
|---|---|---|
| locus tag mg1655 | b3431 | |
| locus tag w3110 | JW3394 | |
| gene name k12 | glgX | |
| locus name | glgX | |
| synonyms of locus name |
| scop id | 51445 |
|---|---|
| superfamily | (Trans)glycosidases |
| pfam id | PF00128; PF02922 |
| pfam domain | Alpha amylase, catalytic domain; Isoamylase N-terminal domain |
| tigrfam id | TIGR02100 |
| name | glgX_debranch |
| function | glycogen debranching enz |
| swissprot name | GLGX_ECOLI |
|---|---|
| description | Glycogen debranching enzyme (EC 3.2.1.-) (Glycogen operon protein|glgX). |
| seq length | 657 |
| fastaseq |
| go id | GO:0005737; GO:0016052; GO:0016052; GO:0000271 |
|---|---|
| go term | cytoplasm; carbohydrate catabolism; carb catab; polysaccharide biosynthesis |
| gene product description | glycogen debranching enzyme |
|---|---|
| comment gene product description | |
| evidence | E |
| context | |
| gene product desc | Enzyme |
| cell location | Cytoplasmic |
| features | CDS |
| functional category code | G |
|---|---|
| functional category | Carbohydrate transport and metabolism |
| reference #1 | Analysis of the Escherichia coli glycogen gene cluster suggests that catabolic enzymes are encoded among the biosynthetic genes. Romeo T., Kumar A., Preiss J. (Gene. 1988 Oct 30; 70(2):363-76) |
|---|---|
| reference #2 | Rapid determination of nucleotides that define tRNA(Gly) acceptor identity. McClain W., Foss K., Jenkins R., Schneider J. (Proc Natl Acad Sci U S A. 1991 Jul 15; 88(14):6147-51) |
| reference #3 | Coordinate genetic regulation of glycogen catabolism and biosynthesis in Escherichia coli via the CsrA gene product. Yang H., Liu M., Romeo T. (J Bacteriol. 1996 Feb; 178(4):1012-7) |
| reference #4 | Analysis of the Escherichia coli glycogen gene cluster suggests that catabolic enzymes are encoded among the biosynthetic genes. Romeo T., Kumar A., Preiss J. (Gene. 1988 Oct 30; 70(2):363-76) |
| phylogenetic profile |
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