gene name: fixB
| locus tag k12 | ECK0043 | information on phylogenetic profile |
|---|---|---|
| locus tag mg1655 | b0042 | |
| locus tag w3110 | JW0041 | |
| gene name k12 | fixB | |
| locus name | fixB | |
| synonyms of locus name | yaaR |
| scop id | 52431; 52467 |
|---|---|
| superfamily | ETFP adenine nucleotide-binding domain-like; DHS-like NAD/FAD-binding domain |
| pfam id | PF00766 |
| pfam domain | Electron transfer flavoprotein alpha subuni |
| TIGRFAM | no information |
| swissprot name | FIXB_ECOLI |
|---|---|
| description | Protein fixB. |
| seq length | 313 |
| fastaseq |
| go id | GO:0016052; GO:0016052 |
|---|---|
| go term | carbohydrate catabolism; carb catab |
| gene product description | predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like |
|---|---|
| comment gene product description | role in anaerobic carnitine metabolism |
| evidence | C |
| context | |
| gene product desc | Carrier, predicted |
| cell location | Cytoplasmic |
| features | CDS |
| functional category code | C |
|---|---|
| functional category | Energy production and conversion |
| reference #1 | Regulation of the carnitine pathway in Escherichia coli: investigation of the cai-fix divergent promoter region. Buchet A., Eichler K., Mandrand-Berthelot M. (J Bacteriol. 1998 May; 180(10):2599-608) |
|---|---|
| reference #2 | The fix Escherichia coli region contains four genes related to carnitine metabolism. Eichler K., Buchet A., Bourgis F., Kleber H., Mandrand-Berthelot M. (J Basic Microbiol. 1995; 35(4):217-27) |
| reference #3 | The fixA and fixB genes are necessary for anaerobic carnitine reduction in Escherichia coli. Walt A., Kahn M. (J Bacteriol. 2002 Jul; 184(14):4044-7) |
| phylogenetic profile |
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